Các chương trình Giáo dục của Giáo hội đã và đang áp dụng cho đến nay:

1.    Chương trình Thần học Căn bản: (1,5năm)

• Chương trình liên kết với Trường Kinh Thánh Galilê đào tạo và cấp chứng chỉ
• Dành cho học viên khao khát học Lời Chúa và mong muốn dự phần hầu việc Chúa tại Hội Thánh địa phương.
• Hình thức tổ chức lớp học: Kết hợp học hàm thụ và tập trung tại Hội Thánh địa phương.
• Cách thức dạy học: Bao gồm Tài liệu học hàm thụ 6 Quyển Cuộc Đời Chúa Cứu Thế; mỗi quyển học trong thời gian 03 tháng với trung bình khoảng 03 lần tập trung để Giáo viên ôn tập, giải đáp thắc mắc và làm bài thi cuối khoá; mỗi lần tập trung từ 01-02 ngày.
• Thời gian học: 1,5 năm ~ 6 môn học.

2.    Chương trình Trung cấp Thần học: (3,5năm)

• Chương trình liên kết với Trường Kinh Thánh Galilê đào tạo và cấp chứng chỉ
• Dành cho học viên đã hoàn tất Chương trình Thần học Căn bản.
• Hình thức tổ chức lớp học: Kết hợp học hàm thụ và tập trung tại các Hội Thánh địa phương cho nhân sự các Hội Thánh cùng khu vực địa lý.
• Cách thức dạy học: Mỗi môn học trong vòng 03 tháng, học viên nhận sách về tự đọc nghiên cứu, cuối khoá học viên tập trung 03 ngày để Giáo viên hướng dẫn ôn tập, giải đáp thắc mắc và làm làm bài kiểm tra cuối khoá.
• Thời gian học: 3,5 năm ~ 14 môn (sau khi hoàn tất Thần học căn bản)

3.    Chương trình Thần học Mục vụ: (3 năm ~ 30 môn học)

• Chương trình giảng dạy và cấp văn bằng của Trường Thần học Trưởng Lão Caoly Hàn Quốc liên kết với Giáo hội Tin Lành Trưởng Lão Liên Hiệp Việt Nam đào tạo.
• Giáo sư và giáo viên giảng dạy: gồm các Giáo sư Viện Thần học Goryo thuộc Giáo hội Trưởng Lão Caoly Hàn Quốc cử sang Việt Nam và các Mục sư Việt Nam đã tốt nghiệp Cử nhân Thần học trở lên giảng dạy.
• Đối tượng tuyển sinh: Dành cho học viên đã hoàn tất Chương trình Thần học Căn bản và tốt nghiệp trung học cơ sở trở lên.
• Hình thức tổ chức lớp học: Học tập trung tại Tổng hội; Tuyển sinh học viên từ các Hội Thánh địa phương.
• Cách thức dạy học: Học viên được xét tuyển về Tổng hội học tập trung mỗi đợt liên tục 02 tuần với 02 môn học; làm bài thi cuối khoá sau khi hoàn tất môn học; 02 tháng học một đợt; mỗi năm học 5 đợt với 10 môn học; sau khi hoàn tất 30 môn học trong 03 năm, học viên sẽ làm bài khảo luận tốt nghiệp.
• Thời gian học: 03 năm 

4.    Chương trình Cử nhân Thần học: (4,5 năm)

• Chương trình giảng dạy và cấp văn bằng của Trường Thần học Trưởng Lão Caoly Hàn Quốc liên kết với Giáo hội Tin Lành Trưởng Lão Liên Hiệp Việt Nam đào tạo.
• Giáo sư và giáo viên giảng dạy: gồm các Giáo sư Viện Thần học Goryo thuộc Giáo hội Trưởng Lão Caoly Hàn Quốc cử sang Việt Nam và các Mục sư Việt Nam đã tốt nghiệp Cao học Thần học trở lên giảng dạy.
• Đối tượng tuyển sinh: Dành cho học viên đã hoàn tất Chương trình Thần học Căn bản và Tốt nghiệp trung học phổ thông trở lên.
• Hình thức tổ chức lớp học: Học tập trung tại Tổng hội; Tuyển sinh học viên từ các Hội Thánh địa phương.
• Cách thức dạy học: Sinh viên được xét tuyển về Tổng hội học tập trung mỗi đợt liên tục 02 tuần với 02 môn học; làm bài thi cuối khoá sau khi hoàn tất môn học; 02 tháng học một đợt; mỗi năm học 5 đợt với 10 môn học; sau khi hoàn tất 42 môn học trong 4,5 năm, học viên sẽ làm luận văn tốt nghiệp.
• Thời gian học: 4,5 năm ~ 42 môn học.

5.    Chương trình Cao học Mục vụ: (3 năm)

• Chương trình đào tạo và cấp văn bằng của Viện Thần học Goryo tại Hàn Quốc và Viện Thần học Cohen tại Mỹ thuộc Giáo hội Trưởng lão của người Hàn Quốc liên kết với Giáo hội Tin Lành Trưởng Lão Liên Hiệp Việt Nam tổ chức.
• Giáo sư thuộc Viện Thần học Goryo và Cohen thuộc Giáo hội Trưởng Lão từ Hàn Quốc và Mỹ được cử sang Việt Nam giảng dạy. 
• Đối tượng tuyển sinh: Dành cho học viên đã hoàn tất Chương trình Cử nhân Thần học hoặc Tốt nghiệp Cử nhân các trường Đại học khác trên toàn quốc.
• Hình thức tổ chức lớp học: Xét tuyển sinh viên; Học tập trung tại Tổng hội.
• Cách thức dạy học: Sinh viên được xét tuyển về Tổng hội học tập trung mỗi đợt liên tục 02 tuần với 02 môn học; làm bài thi cuối khoá sau khi hoàn tất môn học; 02 tháng học một đợt; mỗi năm học 5 đợt với 10 môn học; sau khi hoàn tất 30 môn học trong 03 năm, học viên sẽ làm luận văn tốt nghiệp.
• Thời gian học: 03 năm 

6.   Chương trình Cao học Thần học: (2 năm)

• Chương trình đào tạo và cấp văn bằng của Viện Thần học Goryo tại Hàn Quốc và Viện Thần học Cohen tại Mỹ thuộc Giáo hội Trưởng lão của người Hàn Quốc liên kết với Giáo hội Tin Lành Trưởng Lão Liên Hiệp Việt Nam tổ chức.
• Giáo sư thuộc Viện Thần học Goryo và Cohen thuộc Giáo hội Trưởng Lão từ Hàn Quốc và Mỹ được cử sang Việt Nam giảng dạy. 
• Đối tượng tuyển sinh: Dành cho học viên đã hoàn tất Chương trình Cao học Mục vụ.
• Hình thức tổ chức lớp học: Xét tuyển sinh viên; Học tập trung tại Tổng hội.
• Cách thức dạy học: Sinh viên được xét tuyển về Tổng hội học tập trung mỗi đợt liên tục 02 tuần với 02 môn học; làm bài thi cuối khoá sau khi hoàn tất môn học; 02 tháng học một đợt; mỗi năm học 5 đợt với 10 môn học; sau khi hoàn tất 30 môn học trong 02 năm, học viên sẽ làm luận văn tốt nghiệp.
• Thời gian học: 02 năm (sau khi đã hoàn tất chương trình Cao học Mục vụ)

7.    Các chương trình đào tạo khác

Ngoài ra, Giáo hội cũng liên kết với các Hội đoàn và các hệ phái chính giáo khác trên thế giới có các khoá đào tạo ngắn hoặc dài hạn khác cho nhân sự các ban ngành và giáo phẩm tuỳ vào nhu cầu cần huấn luyện như: Chương trình Britsin dành cho phụ nữ, Chương trình Lửa Trẻ cho Thanh niên, Chương trình Môn đồ hoá, Chương trình huấn luyện Truyền giáo, Chương trình huấn luyện Giáo viên thiếu nhi, Chương trình bồi dưỡng Thần học và Mục vụ cho giáo phẩm, …